Η Μύκονος διαθέτει κρατικό αερολιμένα που λειτουργεί από το 1971 και βρίσκεται σε απόσταση 3 χλμ απ'τη Χώρα. Κατά τους θερινούς μήνες πραγματοποιούνται πολύ συχνά δρομολόγια τόσο απο το εσωτερικό όσο και απο το εξωτερικό (πτήσεις charters απο τις μεγαλύτερες ευρωπαικές πόλεις.)
Για την εξυπηρέτηση των ταξιδιωτών υπάρχει αφετηρία ταξί έξω από το κτίριο του αεροδρομίου. Παρακάτω μπορείτε να βρείτε πληροφορίες για τα δρομολόγια και τις εταιρίες που πραγματοποιούν πτήσεις από και προς τον αερολιμένα Μυκόνου
Αυστρία
| Βιέννη | Austrian Airlines, Niki Airlines |
Γαλλία
| Παρίσι | EasyJet, Europe Airpost, Transavia |
Γερμανία
| Brueggen | Jet AirFly |
| Κολωνία | German Wings |
| Ντισελντορφ | Condor Flugdienst |
| Φρανκφούρτη | Condor Flugdienst |
| Μόναχο | Austrian Ailines |
Ελβετία
| Βασιλεία | EasyJet Switzerland |
| Γενεύη | EasyJet Switzerland |
| Ζυρίχη | Edelweiss Air |
Ηνωμένο Βασίλειο
| Λονδίνο | British Airways, EasyJet, ThomsonFly |
| Μάντσεστερ | EasyJet |
Ισπανία
| Βαρκελώνη | Vueling Airlines |
Ιταλία
| Μπάρι | Volotea |
| Μολόνια | Blue Panorama, Meridiana, Volotea |
| Κατάνια | Blue Panorama |
| Φλορεντία | Vueling Airlines |
| Μιλάνο | Alitalia, Air One, Blue Panorama, EasyJet, Excel Airways, Meridiana, Mistral Air, Neos |
| Νάπολι | Blue Panorama, EasyJet, Meridiana, Volotea |
| Παλέρμο | Volotea |
| Ρώμη | Alitalia, Blue Panorama, EasyJet, Meridiana, Vueling Airlines |
| Τορίνο | Alitalia |
| Βενετία | Volotea |
| Βερόνα | Meridiana, Neos |
Κύπρος
| Λάρνακα | Cyprus Airways |
Λίβανος
| Μπεϊρούτ | Middle East Airlines |
Ολλανδία
| Άμστερνταμ | Transavia |
Πολωνία
| Warsaw | Bingo Airways |
Ρωσία
| Αγία Πετρούπολη | Orenburg Airlines, Transaero Airlines |
Σουηδία
| Στοκχόλμη | SAS |
Τουρκία
| Κωνσταντινούπολη | AtlasJet, BoraJet |
